Bird DNA Barcoding Primers BirdF1 / BirdR1 Primers for DNA Barcoding

Primery čárových kódů ptačí DNA jsou krátké specifické jednovláknové fragmenty DNA (oligonukleotidy), které definují oblast amplifikovanou během PCR během pracovních postupů čárového kódování ptačí DNA.

Další možnosti
DNA Barcoding Primer Mix -  Bird F1 / R1 (ptáci) - ZDE.
DNA Barcoding Primer Mix -  Animal/Metaoa LCO1490 / HCO2198 (savci) - ZDE.
DNA Barcoding Primer Mix -   Plant rbcL (rostliny) - ZDE.

Všechny uvedené produkty je možné získat také ve velikost 2x200 µL.

Podrobnosti 
Základní směsi
Formát jedné zkumavky: Méně zkumavek ke sledování a méně pipetování.
Připravené k použití : Není třeba rehydratovat vaše primery – stačí je přidat do vaší PCR směsi (obsahující vaši hlavní směs, vodu a šablonu DNA).
Pohodlné : Ušetřete čas a špičky pipet s předem namíchaným roztokem.
Snadné : Není třeba provádět výpočty ředění s koncentrací 10x – přidejte 2 µl do 20 µl reakce

Základní páry:
Formát dvou zkumavek: Samostatné zkumavky pro přímý a zpětný primer.
Všestranné: Použijte páry primerů pro PCR a jednotlivé primery pro dopředné a zpětné sekvenování cyklu/Sangerovo sekvenování.
Připravené k použití : Není třeba rehydratovat vaše primery – stačí je přidat do vaší PCR směsi (obsahující vaši hlavní směs, vodu a šablonu DNA).
Standardní pracovní koncentrace: Dodává se v koncentraci 10 uM.

Aplikace:
Tyto primery použijte k amplifikaci standardní oblasti čárového kódu DNA pro ptáky: část mitochondriálního genu cytochrom c oxidázy podjednotky 1 (COI nebo cox1).
Jednotlivé primery v sadě Primer Pair lze také použít jako dopředné nebo zpětné primery pro Sangerovo sekvenování.

Specifikace
Směsi primerů jsou formulovány jako 8 uM směs primerů v pufru s nízkým TE (10 mM Tris-HCl pH 8, 0,1 mM EDTA), vhodném pro nastavení s jednou zkumavkou.
Páry primerů jsou formulovány jako 10 uM zkumavky s jednotlivými primery v pufru s nízkým TE (10 mM Tris-HCl pH 8, 0,1 mM EDTA) vhodném pro nastavení vsádkové PCR. Jednotlivé primery lze také použít pro dopředné nebo zpětné sekvenování pomocí sekvenačních služeb Sanger.

Doporučené použití
Základní směsi: 
Přidejte 2 μl směsi primerů na 20 μl PCR reakce, abyste dosáhli konečné koncentrace 0,8 μM. Přidejte templát DNA a hlavní směs PCR podle protokolu PCR a doplňte vodu čistou pro PCR na konečný objem 20 µl.
Poznámka: Pokud je to žádoucí, lze použít pouze 0,5 µM směsi primerů/rxn (k dosažení konečné koncentrace 0,2 µM), ale to vyžaduje použití 2,5 ul pipety nebo dávkový přístup ke směsi PCR, jak je popsáno pro páry primerů níže.

Základní páry: 
Primery se typicky používají v konečné koncentraci mezi 0,1 uM až 1 uM. Pro typické použití doporučujeme 0,2 µM.
V 20 ul PCR použijte 0,4 ul každého primeru na PCR, abyste dosáhli konečné koncentrace 0,2 uM.
Vzhledem k malým objemům primerů použitých na rxn, doporučujeme vyrobit dávkové směsi PCR (např. 5, 10, 20, 32 rxns) a před přidáním templátu DNA do každé PCR alikvotovat 20 µl kompletní směsi PCR do zkumavek PCR, jak je uvedeno v tabulce níže.
Do tabulky PCR mixu níže bylo přidáno dalších 10 % objemu všech složek, aby se kompenzovaly případné chyby při pipetování během alikvotování.
Pokud si přejete změnit objem použitého primeru nebo použít jakákoli PCR aditiva, přidejte nebo odečtěte dodatečný objem od objemu vody v kvalitě PCR.

Komponenty
Směs primerů (10x zásobní roztok).

Skladování a stabilita
Neotevřené primery by měly být stabilní při pokojové teplotě několik měsíců. Otevřené primery mohou být mezi použitím chlazeny při 4 °C, ale měly by být zmraženy při -20 °C, aby se prodloužila trvanlivost.

Přepravní podmínky
Dodává se při pokojové teplotě.

*obrázky produktu převzaty z oficiálních stránek Bento Lab